核酸與核苷酸的區(qū)別(酸提取的主要步驟及方法)
核酸是由核苷酸縮合而成的大分子,大小差異懸殊:較小的MicroRNA只有22個堿基,分子量約7.2 kd;較大的如人類1號染色體DNA,含有2.5億堿基對,分子量高達(dá)千億kd。
核酸按分子中戊糖的種類分為DNA和RNA兩類,DNA主要集中在細(xì)胞核中,在線粒體和葉綠體中也有少量。RNA主要分布在細(xì)胞質(zhì)中。對病毒來說,或只含DNA,或只含RNA。因此可將病毒分為DNA病毒和RNA病毒兩大類。
核酸按分子中鏈的數(shù)量通常分為單鏈(single strand,ss)和雙鏈(double strand,ds)兩類。DNA一般為雙鏈,作為信息分子;RNA則單雙鏈都有。
其實還有三鏈和四鏈DNA存在,但比較罕見,一般是在特殊情況下形成的,比如端粒的G-四鏈體(G-quadruplex)結(jié)構(gòu)等?,F(xiàn)在已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了G-四鏈體結(jié)構(gòu)的RNA,定位于細(xì)胞核處的端粒DNA(PNAS August 17, 2010 107 (33) 14579-14584)。
G-四鏈體結(jié)構(gòu)的RNA,引自PNAS,2010
核苷酸是核酸的構(gòu)件,可分解成核苷和磷酸,核苷又可分解為堿基和戊糖。戊糖有D-核糖和D-2-脫氧核糖兩種,分別對應(yīng)RNA和DNA。堿基則分為嘌呤和嘧啶兩類。
嘧啶堿(pyrimidine, py) 是嘧啶的衍生物,共有三種:胞嘧啶(cytosine, Cyt)、尿嘧啶(uracil, Ura)和胸腺嘧啶(thymine, Thy)。其中尿嘧啶只存在于RNA中,胸腺嘧啶只存在于DNA中,但在某些tRNA中也發(fā)現(xiàn)有極少量的胸腺嘧啶。胞嘧啶為兩類核酸所共有,在植物DNA中還有5-甲基胞嘧啶,一些大腸桿菌噬菌體核酸中不含胞嘧啶,而由5-羥甲基胞嘧啶代替。
嘧啶堿
嘌呤堿(purine, pu) 由嘌呤衍生而來,常見的有兩種:腺嘌呤(adenine, Ade)和鳥嘌呤(guanine, Gua)。嘌呤分子接近于平面,但稍有彎曲。
嘌呤堿
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自然界中還有黃嘌呤、次黃嘌呤、尿酸、茶葉堿、可可堿和咖啡因。前三種是嘌呤核苷酸的代謝產(chǎn)物,是抗氧化劑,后三種含于植物中,是黃嘌呤的甲基化衍生物,能夠競爭性抑制磷酸二酯酶,升高cAMP濃度,具有興奮、強(qiáng)心、利尿作用。
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咖啡因
此外,一些植物激素,如玉米素、激動素等也是嘌呤類物質(zhì),可促進(jìn)細(xì)胞的分裂、分化。一些抗生素是嘌呤衍生物。如抑制蛋白質(zhì)合成的嘌呤霉素,是腺嘌呤的衍生物。
嘌呤霉素
不同生物體中各種堿基的含量是不同的。(A+T)/(G+C)稱為不對稱比率,不同生物有所不同。比如人的不對稱比率為1.52,藤黃八疊球菌只有0.35。這也說明四核苷酸假說是錯誤的,萊文的測定結(jié)果實在太不準(zhǔn)確了。
除以上五種基本的堿基以外,核酸中還有一些含量極少的稀有堿基,其中大多數(shù)是甲基化堿基。甲基化發(fā)生在核酸合成以后,對核酸的生物學(xué)功能具有重要意義。核酸中甲基化堿基含量一般不超過5%,但tRNA中可高達(dá)10%。
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